2023年3月6日下午,受新加坡科技局生物信息研究所余维淼教授的邀请,智慧医疗研究院执行院长徐军教授访问生物信息研究所并受邀在生物信息研究所做题目为“Computational radiology and pathology for disease prevention, diagnosis, and prognosis(面向疾病预防、诊断和预后的放射影像和病理图像计算)”的学术报告。
报告主要围绕智慧医疗研究院正在开展的以机器学习驱动的放射影像学和组织学图像分析及影像和组织病理等多模态多尺度数据融合等相关研究成果的讨论。放射影像学和常规组织病理学切片图像中包含很多有价值的临床诊断、治疗和预后等信息。随着先进的医学图像分析和高分辨率数字病理扫及成像技术的快速发展,我们可以更方便地从放射影像学和常规组织病理学图像中获得疾病的多尺度图像生物标记物描述,例如毫米尺度和微米尺度的图像表型描述,其中很多是人眼无法区分的图像模式。通过定量地获取这些疾病的图像模式和表型描述,我们可以构建模型辅助医生更准确地检测和诊断疾病,并尝试评估或预测疾病的复发风险、疾病侵袭性程度、长期生存率以及患者对治疗的响应。近10多年来,智慧医疗研究院团队一直致力于机器学习驱动的放射影像学和组织学图像分析工具的研究和开发,通过构建基于放射影像和组织学图像的“图像生物标记物”模型,期望未来能够更好地辅助医生实现疾病的预防、诊断和预测疾病进展以及对患者对治疗的响应。
报告中徐军介绍了研究院近期发表的相关研究成果,主要包括:1)基于肝脏CT影像组学模型预测肝细胞癌的微血管浸润,2)慢性粒细胞白血病的计算机辅助诊断,3)胆管癌患者肿瘤微环境的定量分析和生存预测,4)非小型细胞肺癌患者对免疫治疗的响应预测,5)基于乳腺组织学图像定量分析的三阴性乳腺癌亚型分类和预后分析,以及 6)小鼠曲细生精管分期及细胞组成成分分析。最后,徐军还介绍了智慧医疗研究院的医工团队情况及研究领域。
本次学术报告由新加科技局生物信息研究所余维淼教授主持,旨在聚焦双方感兴趣的领域,进一步加强两个单位教师和学生的相互了解,深入合作和交流。在问答与互动环节,与会人员与徐军进行了广泛深入地讨论和交流。最后,生物信息研究所Kwee Kuan教授对报告做了总结。本次学术报告的参会人员除了新加坡科技局本单位的研究人员外,还包括华大基因,默沙东等全球领先的医药公司的研究人员。报告采用了线下线上混合的方式,其中线下参会人员40多人,线上30多人。
智慧医疗研究院和新加坡科技局生物信息研究所在人才培养、科学研究等方面已经开展了多年的合作。目前在计算病理、前列腺癌智能自动Gleason分级、小鼠生精管自动分期等方面已经合作发表了多篇高水平论文。此次报告也是疫情之后,中新双方团队的第一次面对面交流。双方计划在科研项目联合申请,教师的交流与合作,硕士、博士等高层次人才培养方面进一步加强合作。
延伸阅读
新加坡科技研究局(Agency for Science, Technology and Research;简写为A*STAR),是新加坡贸易和工业部下属的自治研究机构,其前身是成立于1991年的新加坡科学技术局。A*STAR成立的目标是促进新加坡科研和人才的整合,以协助新加坡向知识型经济体转型和迈进。其下属研究院分两个分支:生物医药研究和科学工程研究,各自统领若干下属研究所,开展相关方面的科学研究。还直辖交叉学科整合理事会、研究生学院、速创科技私人有限公司,以及企业公共事务服务部门,以达到各个研究所的资源共享。A*STAR是新加坡研究团体中重要的催化剂、推动者和召集者。通过开放式创新,A*STAR与公共和私营部门的合作伙伴进行合作,并利用科学技术使经济和社会受益。生物信息学研究所 (Bioinformatics Institute, BII) 隶属A*STAR生物医药研究理事会,于 2001 年 7 月成立。BII位于新加坡的Biopolis街道,是A*STAR的计算生物学研究机构,同时也是国家生物信息学资源中心。BII旨在通过开发人工智能/机器学习分析方法来理解生物医学现象背后的生物分子机制。BII广泛地分析生物学和临床数据,包括组学数据(生物分子序列、表达谱、表观遗传学数据)、大分子的 3D 结构。BII的应用研究涉及传染病、计算病理、天然产物研究、精准医学、癌症研究和药物发现。